\chapter{Название приложения~\ref{app2}\label{app2}}

\section{Название подраздела~\ref{app2.1} 
в приложении~\ref{app2}\label{app2.1}}

Как показано в приложении~\ref{app2}, подразд.~\ref{app2.2}, 
пункт~\ref{app2.2.1} ...

  \subsection{Название пункта~\ref{app2.1.1} в приложении~\ref{app2}, подразд.~\ref{app2.1}\label{app2.1.1}}
     \subsubsection{Название подпункта  пункта~\ref{app2.1.1} в приложении~\ref{app2}, подразд.~\ref{app2.1}}
  \subsection{Название\label{app2.1.2}}
     \subsubsection{Название}
\section{Название подраздела в приложении 2\label{app2.2}}

  \subsection{Название\label{app2.2.1}}
     \subsubsection{Название}
  \subsection{Название\label{app2.2.2}}
     \subsubsection{Название}